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大脑的“保护因子”,Reelin 蛋白质新研究:治疗阿尔茨海默氏症的重要途径
IT之家8月3日消息,科学家表示越来越多的证据表明科学,Reelin蛋白质在大脑中起着“保护因子”的作用,可以保护大脑器官,遏制阿尔茨海默氏症和其他衰老疾病症状。图源:YakeelT.Quiroz-GaviriaandJustinSanchez/MassachusettsGeneralHospital 去93 0 2024-08-03 11:06
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模拟 5 亿年自然进化史,全新生命科学大模型 ESM3 诞生!前 Meta 老将力作 LeCun 转赞
能抗衡AlphaFold3的生命科学大模型终于出现了。初创公司EvolutionaryScaleAI发布了他们最新的98B参数蛋白质语言模型ESM3。不仅支持序列、结构、功能的all-to-all推理,团队还在实验中发现,它设计的新蛋白质相当于模拟自然界5亿年的进化。继AlphaFold3更新后,我们又看到了一个生命科学领域的大模型ESM3。模型开发团队来自于名为EvolutionaryScale148 0 2024-06-27 00:24
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AI 成功改写人类 DNA:全球首个基因编辑器开源,近 5 倍蛋白质宇宙 LLM 全生成
【新智元导读】刚刚,分子生物学界引爆核弹级消息:人类的DNA,已经能由AI重新改写了!初创公司Profluent宣布开源了世界首个AI设计基因编辑器,成功编辑了人类细胞中的DNA。这可太科幻了,如果有机会,你会选择「改造」自己的DNA吗?AI,能够重写人类基因组了?就在刚刚,初创公司Profluent宣布,完全由AI设计的基因编辑器,已经成功编辑了人类细胞中的DNA。也就是说,世界上首个使用AI从123 0 2024-04-24 14:03
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科学家研发出全新血液检测技术,号称可精准识别 18 种早期癌症
IT之家1月10日消息,癌症一直是人类健康的一大杀手,全球每六个人中就有一个死于癌症。据TheGuardian报道,令人振奋的是,美国科学家们近日开发出了一种简单易行的DNA检测技术,能够识别包括肺癌、乳腺癌、肠癌在内的18种早期癌症。这项研究发表在知名医学期刊《BMJOncology》上,被专家们称为癌症检测领域的“变革者”。据IT之家了解,传统癌症筛查方法往往存在侵入性高、成本昂贵、对早期癌症165 0 2024-01-10 19:23
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癌症新见解,研究揭示了突变蛋白在肿瘤生长中的作用
IT之家11月29日消息,科学家近日公布了一项新的研究,首次解决突变蛋白质如何驱动肿瘤生长的争论。这一发现不仅有助于重新思考癌症的治疗方式,而且可能导致新的和改进的治疗方法。目前学术界共识是,TP53基因控制下达制造蛋白质p53的指令,而p53在修复或破坏受损细胞DNA方面起着关键作用。p53是一种肿瘤抑制因子,调节细胞分裂并防止细胞增殖过快或不受控制的方式增殖。在人类癌症中,超过一半都存在p53175 0 2023-11-29 13:47
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麻省理工学院 FrameDiff 工具问世,利用 AI 设计蛋白质结构助力医疗发展
IT之家7月13日消息,麻省理工学院的研究人员开发了一种名为FrameDiff的AI工具,使用生成式人工智能设计新的蛋白质结构,目的是加速药物开发和改进基因治疗。据悉,新型蛋白质结构的设计仍然是蛋白质工程中跨生物医学和化学应用的挑战。FrameDiff可以构建超越自然变种的蛋白质,这种方法可以生成与现有设计不同的蛋白质结构,并有望加速蛋白质结构的生成过程,从而推动药物研发、诊断和工业应用的进展。▲175 0 2023-07-13 12:19
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AI 能生成超越自然界的新型蛋白质,可用于制造特定机械性能材料
IT之家4月24日消息,蛋白质是生命的基础,也是许多新型材料的灵感来源。然而,自然界中已知的蛋白质只是冰山一角,还有无数未被发现的蛋白质等待探索。如何快速有效地设计出具有特定结构和功能的新型蛋白质,是一个巨大的挑战。为了解决这个问题,麻省理工学院(MIT)的研究人员利用人工智能技术,开发了一种能够生成超越自然界的新型蛋白质的方法。他们创建了一种基于机器学习的算法,可以根据预设的结构目标,预测出能够218 0 2023-04-24 08:16
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百度李彦宏创立的百图生科发布 AIGP 平台,提供多种蛋白质生成能力
IT之家3月23日消息,IT之家从百图生科官方公众号获悉,3月23日,百图生科在北京发布生命科学大模型驱动的AIGP——AIGeneratedProtein平台。官方称,旨在将这一技术平台的能力与更多行业伙伴分享,利用设计创新蛋白质的能力,共同研发更多的前沿药物和其他生命科学项目,也通过挑战性的新任务,驱动AIGP平台的技术进步。在发布前,AIGP平台已经进行了一段时间的内部测试,有近20家合作伙198 0 2023-03-23 19:28
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MIT 最新研究:AlphaFold 蛋白质预测能力太差,目前利用价值还很低
2018年,Deepmind首次发布基于深度神经网络的蛋白质结构预测数据库AlphaFold,在蛋白质预测中实现了最先进的性能;去年,AlphaFold2获得了98.5%的蛋白质预测率;前段时间,Deepmind又重磅发布了数据集更新,称目前的AlphaFold已经预测了几乎所有已知的蛋白质。如何有效识别药物作用机制在今天仍然是一个巨大挑战,计算对接的方法已被广泛用于预测药物结合靶点。有了大规模蛋303 0 2022-09-15 17:48
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三十年资深药企人 Derek Lowe 抨击 AlphaFold:靠结构预测做药“纯属自嗨”
DeepMind近日公布了AlphaFold的最新进展:已预测出超过100万个物种的2.14亿个蛋白质结构,几乎涵盖了地球上所有已知蛋白质,再次刷新了我们对它的期待。AlphaFold2横空出世时的热烈场景重现,再次在国内外的社交媒体上引发热议。但作为“圈内人”的生命科学领域研究者们,对AlphaFold此次公布的成果却褒贬不一。此前潘毅、周耀旗、许东等几位生物信息学领域的学者曾表示:AlphaF350 0 2022-08-21 21:54
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谷歌 DeepMind:已发现科学界几乎所有已知的蛋白质结构
IT之家7月28日消息,谷歌DeepMind今日宣布,其发布的免费数据库对科学界已知的几乎所有蛋白质的结构进行了预测。DeepMind在2020年凭借其AlphaFoldAI软件轰动了科学界,该软件可以对蛋白质结构进行高度准确的预测,这些信息可以帮助科学家了解它们的工作原理,从而有助于治疗疾病和开发药物。去年夏天,DeepMind 首次通过与欧洲分子生物学实验室(EMBL)合作建立的数据290 0 2022-07-28 19:36
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谷歌 AI 加入蛋白质解析大军:ProtENN 模型助增 680 万个蛋白质注释词条,登顶 Nature 子刊
要说“AIforScience”的扛大旗者,大家也许都会首先想到DeepMind:2018年,DeepMind推出蛋白质折叠结构预测模型AlphaFold,从氨基酸序列计算预测蛋白质结构,不仅为Alpha系列锦上添花,奠定了其在AI创新上的领头羊地位,还彰显了深度学习攻破其他领域难题的潜力。AlphaFold出世后,“AIforbiology”(将人工智能用于生物学研究)成为人工智能领域的研究潮流334 0 2022-03-04 16:36
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从头设计路线,我国科学家建立蛋白质设计新方法
IT之家2月10日消息,据中国科大官网,中国科学技术大学刘海燕教授、陈泉副教授团队采用数据驱动策略,开辟出一条全新的蛋白质从头设计路线。IT之家了解到,相关成果以“用于蛋白质设计的以主链为中心的神经网络能量函数”为题于北京时间2月10日发表于Nature。据介绍,蛋白质是生命的基础,是生命功能的主要执行者,其结构与功能由氨基酸序列所决定。目前,能够形成稳定三维结构的蛋白质,几乎全部是天然蛋白质,其271 0 2022-02-10 10:28
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AlphaFold2 被超越,中国团队刷新全球蛋白质结构预测纪录
AlphaFold2的纪录,刚刚被刷新了。最新消息,全球持续蛋白质结构预测竞赛CAMEO(ContinousAutomatedModelEvaluatiOn)上,DeepMind旗下AlphaFold2的纪录被刷新。HeliXonAI,一个此前名不见经传的“新面孔”,加冕第一。同时,在全球结构预测领域主要评价指标lDDT(LocalDistanceDifferentTest)中,HeliXonAI419 0 2021-12-14 13:10
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AI 发现人类肾细胞有一半结构未知,UCSD 最新研究登上 Nature,算法已开源
我们的细胞再向下一级究竟有什么?细胞核、线粒体、内质网、高尔基体……在中学生物课里我们知道了这些,然而它们就是亚细胞结构的全部吗?绝对不是!加州大学圣地亚哥分校(UCSD)医学院的研究人员和合作者们,通过AI技术分析出了人类肾脏细胞的70种亚系统,发现其中有一半都是人类未知的。这项研究登上了最新一期的Nature。肾细胞中一半成分未知科学家研究细胞内部的结构主要使用两种技术:荧光显微镜成像和生物物519 0 2021-11-25 16:17
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AI 成功预测蛋白质复合体结构,北大校友领衔登上 Science
AlphaFold和RoseTTAFold等AI的横空出世,可以说打开了蛋白质预测新世界的大门。而现在,依靠这俩AI模型的“组合拳”,科学家们又有了新的突破:首次确定了超过100种“疑似”全新蛋白质复合体,并为700多种此前结构未知蛋白质复合体提供了3D结构预测。也就是说,现在,AI现在不仅能预测蛋白质单体,还能成功预测蛋白质之间的相互作用了。研究人员兴奋地表示:我们的结果是结构生物学新时代的一个411 0 2021-11-19 13:18
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我国生物合成领域取得重大突破,全球首次实现从一氧化碳到蛋白质的合成
IT之家10月31日消息,据中国农业信息网,我国在一碳生物合成领域取得重大突破性进展。中国农业科学院饲料研究所昨日宣布:全球首次实现从一氧化碳到蛋白质的合成,并已形成万吨级工业产能。官方表示,这一举突破了天然蛋白质植物合成的时空限制,为弥补我国农业最大短板——饲用蛋白对外依存度过高提供了国之利器,对于我国粮食安全、经济安全和绿色可持续发展以及“双碳”目标的实现具有长远意义。众所周知,自然界中最原始433 0 2021-10-31 17:08
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《科学》杂志最新研究填补空白,蛋白质、基因组与人类疾病从此有了关联图
IT之家10月18日消息,剑桥大学于14日在《科学》杂志上发表了一项最新研究,科学家们通过基因组中的共同起源发现了不同人类疾病之间的数百种联系,从此填补了我们人类在这一方面的研究空白,解决了将基础科学转化为临床可解的重要瓶颈。IT之家了解到,剑桥大学医学研究委员会(MRC)流行病学部门的科学家领导的国际研究小组通过基因组中的共同起源发现了不同人类疾病之间的数百种联系,可以按器官、症状或临床专业对疾435 0 2021-10-18 07:37
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人类生物学的大突破,就这样被 AI 做到了
多年之后,当人们总结这些年的AI浪潮,最具应用价值突破的会是什么?不会是2016年AlphaGo下棋超过人类最强棋手李世石,而会是AlphaFold2准确预测了「蛋白质折叠」。▲ 图自DeepMind2020年12月的「蛋白质结构预测比赛(CASP)」上,DeepMind的AlphaFold2算法预测取得第一名,达到了实验解析的精度。DeepMind的CEO德米斯・哈萨比斯(DemisH387 0 2021-08-23 15:30
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最新研究表明人体的大部分DNA,不止是“备胎”
人类的基因手册提供了构成人类身体的蛋白质指令,但是残酷的现实摆在人类面前,仅有不足2%的DNA编码人类身体,这意味着人体充满了“垃圾DNA”。人体剩下的98.5%DNA序列被称为“垃圾DNA”,长期以来,科学家认为垃圾DNA是无用的,这些无蛋白质编码序列就像书稿中的胡言乱语,但是最新研究表明,人体基因组中的“垃圾部分”可能仍然发挥着重要作用。没有意义的文字生物体拥有一种独特的基因编写方式,人类基因......568 0 2019-08-22 12:21